Wyjaśnienie zmiennych Omicron: czym one są i co wiemy

Byczy podtyp BA.5 omicron może stać się dominującą formą w Nowej Zelandii dla Covid-19 w ciągu najbliższych dwóch tygodni. Ale już są wczesne oznaki, że może go zastąpić inny wschodzący wariant Omicron. Czym one są i co wiemy? Wyjaśnia to reporter naukowy Jamie Morton.

Alfa, Beta, Delta, Omicron BA.2, BA.5, a teraz BA.2.75.

Dla reszty z nas może być trudno nadążyć, ale wirusologowie dobrze rozumieją powód, dla którego pojawiają się nowe warianty i podzmienne, takie jak te, które powodują spustoszenie.

W miarę rozprzestrzeniania się wirusy rozmnażają się, kopiując własny genom. W tym procesie czasami popełniają błędy – tworząc to, co znamy lepiej jako mutacje.

Im dłużej wirus przenosi się z jednego gospodarza na drugiego, tym łatwiej mu się rozprzestrzeniać i tym lepiej, wcześniej wie, jak go zainfekować.

Jeśli znajdziesz konkretną mutację, która oferuje jakąś korzyść, na przykład lepszą inwazję naszych komórek, to ten korzystny „błąd” pozostanie.

We wszystkich wariantach Covid-19, które do tej pory widzieliśmy, główną zaletą były sprytne kombinacje określonych mutacji, które zmieniają strukturę, które pomogły mu szybciej się rozprzestrzeniać.

Zdarzają się one głównie wokół białka „kolca” wirusa, które wykorzystuje do przyłączenia się do określonego receptora, który umożliwia mu wejście do naszych komórek – i to właśnie wydarzyło się w ostatniej serii iskier omikronowych.

Licencjat 1

Kiedy Omicron zadebiutował w RPA pod koniec 2021 r. i rozpoczął globalną ekspansję, został oznaczony jako B.1.1.529 lub BA.1.

Naukowcy wkrótce odkryli, że ma przerażającą liczbę mutacji i zdolność do replikacji w drogach oddechowych 70 razy szybciej niż delty.

Chociaż jest mniej śmiertelna niż Delta — badania wykazały, że infekcja omikronem jest o 91 procent mniej śmiertelna niż Delta, przy 51 procent niższym ryzyku hospitalizacji — wariant szybko okazał się lepszy w rozprzestrzenianiu się i ucieczce z odporności.

Podczas gdy dwie dawki szczepionki zapewniają tylko 30 do 40 procent ochrony przed infekcją i około 70 procent przed hospitalizacją, niedawna dawka przypominająca podniosła skuteczność przeciwko infekcji do około 75 procent – ​​i 88 procent w przypadku ciężkiej choroby.

Delta szybko przejęła kontrolę – ale nie minie dużo czasu, zanim era „oryginalnego” Omicrona również się skończy.

Licencjat 2

Podczas gdy BA.1 zaczął pojawiać się na granicy Nowej Zelandii pod koniec ubiegłego roku, w jego ślady pojawił się inny podtyp, BA.2.

Ponieważ obydwa zaczęły się szeroko rozprzestrzeniać w naszych społecznościach późnym latem, pierwsza fala w kraju była napędzana przez kombinację tych dwóch.

Było to w przeciwieństwie do miejsc, w których BA.1 uderzył wcześnie na zewnątrz, tylko po to, by skontrować drugie fale napędzane przez BA.2.

W połowie jesieni BA.2 z powodzeniem wyeliminował BA.1, który według szacunków jest od 30 do 50 procent mniej zaraźliwy niż jego następca.

Brytyjska Agencja Bezpieczeństwa Zdrowia uznała za prawdopodobne, że wysoka przenośność BA.2 i krótszy okres sekwencyjny – czas między wystąpieniem objawów u osoby zakażonej, a wystąpieniem objawów u następnej osoby – były czynnikami odpowiedzialnymi za wysoką częstość występowania.

Co ważne, agencja zgłosiła również brak znaczących różnic w skuteczności szczepionki przeciwko tym dwóm gatunkom; W rzeczywistości ochrona przed objawową chorobą była nieco wyższa dla BA.2 (74% po dwóch do czterech tygodniach) niż dla BA.1 (69%).

Chociaż badania wykazały, że BA.2 może być bardziej odporny na leczenie przeciwciałami monoklonalnymi, nie ma wystarczających danych, aby wykazać, że powoduje on choroby u ludzi.

W porównaniu z BA.1 i BA.2, przypadki BA.3, które niosą genetyczną „delecję” podobną do BA.1, pozostają niezwykle rzadkie.

Licencjat 4 i licencjat 5

Modelarze wcześniej wybrali naszą drugą falę Omicron do startu późną zimą lub nawet wiosną — ale pojawienie się BA.4 i BA.5 wydaje się teraz przesunąć ten rajd na lipiec.

Chociaż badania wciąż się pojawiają, te dwa podtypy mogą być o 36 procent bardziej zakaźne niż BA.2 – i znacznie lepiej unikać odporności.

„BA.2 nadal dominuje w całym kraju – ale około jeden na trzy przypadki społeczności w Nowej Zelandii to już BA.4 lub BA.5 – a większość to BA.5” – powiedziała wirusolog z University of Otago, dr Gemma Geojgan.

„Dlatego możemy oczekiwać, że BA.5 stanie się wariantem dominującym – lub będzie stanowić ponad 50 procent przypadków – w ciągu najbliższych dwóch tygodni”.

Najnowszy nadzór nad ściekami wykazał, że w 19 z 20 miejsc wynik BA.5 był pozytywny.

– Wygląda na to, że idzie na banany.

BA.4 i BA.5 zostały po raz pierwszy wykryte w Republice Południowej Afryki – odpowiednio w styczniu i lutym – zanim rozprzestrzeniły się na całym świecie.

Pod koniec czerwca stanowiły około 55 procent współczesnych próbek na świecie.

Chociaż dzieliły wiele takich samych mutacji co BA.1, były bardziej podobne do BA.2 – i znowu nosiły dodatkowe mutacje, które mogły zmienić ich właściwości.

Oba podtypy miały identyczne geny białkowe, a także nosiły mutację L452R – coś, co wcześniej znaleziono w Delcie, co miało pomagać wirusowi lepiej przylegać do ludzkich komórek.

Inna zmiana, zwana mutacją F486V, w pobliżu miejsca, w którym kolczaste białko przyłącza się do naszych komórek, może pomóc w obejściu naszej odpowiedzi immunologicznej.

Licencjat 2.12.1

Pod koniec ubiegłego miesiąca BA.2.12.1 – dwunasty szczep odchodzący od BA.2 – zawierał około jednego na 10 seryjnych przypadków Covid-19 w Nowej Zelandii.

„Ta alternatywa ma również przewagę rozwojową nad BA.2 i jest teraz wszechobecna, zwłaszcza w Stanach Zjednoczonych, gdzie stała się niesforna” – powiedział Geoghegan.

„Chociaż obserwujemy wiele przypadków BA.2.12.1 w Nowej Zelandii, jest wiele przypadków importowanych dla tego wariantu z zagranicy”.

Naukowcy odkryli, że BA.2.12.1 zawiera około 20 takich samych mutacji co BA.1 – plus siedem innych, w tym L452R. Ale nic nie wskazuje na to, że BA.2.12.1 zastąpi BA.4 i BA.5.

W jednym z badań opublikowanych w tym tygodniu zbadano zdolność przeciwciał od osób, które otrzymały co najmniej trzy dawki szczepionki mRNA lub które otrzymały dwie dawki, a następnie zostały zakażone preparatem Omicron, do neutralizacji nowych podwariantów.

Odkryli, że podczas gdy BA.2.12.1 była nieco bardziej odporna niż BA.2 u osób zaszczepionych i wzmocnionych, BA.4 i BA.5 były co najmniej cztery razy bardziej odporne niż jego poprzednik.

Kawaler 2,75

Jeśli teraz coś unosi się w powietrzu z możliwością, że BA.4 i BA.5 wyjdą ze środka sceny, to jest to BA.2.75.

Potwierdzone w Nowej Zelandii po raz pierwszy w piątek – zgłosiły to dwie osoby, które niedawno podróżowały z Indii – BA.2.75 to kolejna nowa alternatywa drugiej generacji dla BA.2.

„Wiemy, że BA.2.75 ma pewne właściwości, które wydają się zwiększać jego zdolność do unikania odporności, podobnie jak podwarianty BA.4 i BA.5 Omicron, i istnieją pewne wczesne dowody na to, że mogą być nieco bardziej przenośne BA.2” – podało wczoraj Ministerstwo Zdrowia.

„Nie ma obecnie dowodów na to, że prowadzi to do poważniejszej choroby, chociaż ocena dowodów jest na bardzo wczesnym etapie”.

BA.2.75 pakował wszystkie mutanty BA.2 – plus osiem innych do białka kolczastego.

„Dla porównania, BA.4 i BA.5 mają o trzy mutacje więcej niż BA.2 – więc ta mutacja wydaje się być bardziej rozbieżna niż inne” – powiedział Geojegan.

„Z danych zewnętrznych wynika, że ​​BA.2.75 ma tak silną przewagę wzrostu, że jeśli dominuje gdzie indziej, prawdopodobnie również tutaj.

„A przy bardziej zrelaksowanych ustawieniach granic nie będziemy tak naprawdę mieli takiej samej przewagi, jak wcześniej”.

Dopóki Omicron może nadal ewoluować – zwłaszcza wśród przewlekle zakażonych ludzi, ale także u zwierząt – Geoghegan powiedział, że w miarę rozwoju pandemii możemy spodziewać się większej liczby podzmiennych.

„Nie sądzę, aby ten wirus miał jakiekolwiek granice antygenowe, gdzie może się udać”.