Covid-19: 5535 nowych przypadków, 14 kolejnych zgonów; Wyniki odprowadzania ścieków

Obecnie w Nowej Zelandii jest 5535 nowych przypadków Covid-19 w społeczności – i kolejnych 14 zgonów związanych z Covid.

Ministerstwo Zdrowia podało, że 720 osób zostało zarażonych wirusem w szpitalu, w tym 21 na oddziale intensywnej terapii.

Spośród 720 osób hospitalizowanych z wirusem, 18 znajduje się w Northland, a 96 w Waitemata; 63 dzielnice w Manukau; 82 w Auckland; 60 z nich znajduje się w Waikato; 40 w Zatoce Obfitości; 11 w jeziorach; 32 w Zatoce Hooka; 40 w środkowej części; 13 w Wanganui; 16 w Taranaki; dwa w języku tyrautycznym; sześć w Wairarapa; 61 w DC i Coast/Hut; 11 z nich znajduje się w Nelson Marlborough; 132 w Canterbury/West Coast; 13 na południu Canterbury i 24 na południu.

Średni wiek osób z Covid w szpitalu to 66 lat.

Siedmiodniowa ciągła średnia hospitalizacji osób z Covid wynosi obecnie 762 – w porównaniu z 737 tydzień wcześniej.

Spośród 14 osób, które zmarły na wirusa, trzy pochodzą z okolic Auckland, trzy z Waikato, cztery z Hawke’s Bay, jedna z Taranaki, jedna z Central Central, jedna z okolic Wellington i jedna z z południa.

Sześciu z nich miało 80 lat, a 8 miało ponad 90 lat. Wśród nich było 11 kobiet i trzech mężczyzn.

„To bardzo smutny czas dla Wanau i przyjaciół, a nasze myśli i kondolencje są z nimi” – powiedziało Ministerstwo Zdrowia. „Z szacunku nie będziemy komentować tego dalej”.

Ministerstwo podało również, że podano już 248 989 drugich dawek przypominających.
Wczoraj w całym kraju podano 24 pierwsze dawki; 33 druga dawka cztery podstawowe trzecie dawki; 817 pierwszy strzał przypominający; 5476 drugich strzałów przypominających; 77 pierwsza dawka dla dzieci i 497 druga dawka dla dzieci.

Ile Covid jest w ściekach w Twojej okolicy?

Liczby departamentu pojawiły się, gdy niedawno opublikowane dane dotyczące ścieków dodały nową perspektywę do fali Omicron, pokazując, że to, czego naukowcy nauczyli się z pobierania próbek ścieków, ogólnie zgadza się z dziennymi liczbami przypadków.

ESR online Panel licznika ścieków Covid-19uruchomiony w zeszłym tygodniu, Kiwis był w stanie sprawdzić, ile naukowcy SARS-CoV-2 znajdują w ich okolicy — a następnie porównać to z liczbą przypadków zgłaszanych każdego dnia.

Ponieważ ślady wirusa lub jego RNA można wykryć dzięki temu, co robimy w toalecie, epidemiologia oparta na ściekach odgrywa coraz większą rolę w naszym zestawie narzędzi do pandemii.

W ramach monitoringu próbki z każdej rośliny przesyłane są do ESR, gdzie naukowcy koncentrują wirusy, ekstrahując z nich wirusowe RNA.

Gdy w próbce jest wystarczająco dużo wirusa, aby oszacować jego wielkość, naukowcy są w stanie przekształcić to w miano wirusa kopii genomu dziennie na osobę – pomagając zbudować obraz rozprzestrzeniania się infekcji w niektórych populacjach.

Dane krajowe z tego monitoringu wykazały, że wymierne ilości wirusów zostały przechwycone tylko w około 10 procentach witryn w pierwszych tygodniach roku.

Do połowy lutego wymierne poziomy wykryto w ponad jednej czwartej z nich.

Tydzień później odsetek ten wzrósł do około dwóch trzecich – a teraz wirus został wykryty, często na wysokim poziomie, we wszystkich monitorowanych witrynach w całym kraju.

„Przed lutym widzieliśmy Covid-19 tylko w kilku zlewniach – głównie w Auckland – ale potem naprawdę wystartował” – powiedziała dr Joanne Hewitt, główny naukowiec ESR.

„Wraz z rozprzestrzenianiem się firmy Omicron w całym kraju zaobserwowaliśmy, że poziomy wzrosły nie tylko 10 razy, ale 1000 razy w porównaniu z poziomami tła”.

W Auckland, 13 lutego, nadal było tylko 220 przypadków społeczności i prawie 387 000 kopii genomu wirusa na osobę.

Ale do 6 marca, u szczytu pierwszej fali, wskaźniki te wzrosły do ​​10 779 przypadków i ponad 14,2 miliona kopii genomu na mieszkańca dziennie.

Podczas gdy te kopie genomu spadły do ​​około 5,2 miliona kopii genomu w połowie kwietnia, do połowy lipca ponownie wzrosły do ​​12,3 miliona kopii, w wyniku obecnej fali napędzanej przez podwariant BA.5 Omicron.

Dane pokazały podobne, ale nieco inne obrazy w innych obszarach.

W Canterbury, gdzie ślady wirusa znaleziono w ściekach w środku lata, ilość wirusa osiągnęła najwyższy poziom kilka tygodni później niż w Auckland, osiągając ponad 12,2 miliona kopii jego genomu na osobę dziennie 20 marca.

10 lipca liczba ta wzrosła do 28,7 miliona kopii genomu na mieszkańca dziennie, ale potem spadła.

W Wellington obserwowane ilości osiągnęły 39,7 miliona kopii genomu na mieszkańca dziennie 10 lipca – blisko wspięcia się do 45,8 miliona kopii genomu odkrytych w regionie na wysokości pierwszej fali, 13 marca.

W skali kraju wolumeny nieznacznie spadły z 15,9 kopii genomu na mieszkańca dziennie w dniu 6 marca do 5,6 miliona w połowie czerwca, a następnie ponownie wzrosły do ​​13,3 miliona kopii w ostatni weekend.

Podczas gdy niektórzy eksperci spekulują, że ta fala mogła już osiągnąć szczyt, Hewitt powiedział, że pomocne będą wyniki dotyczące ścieków z zeszłego tygodnia.

Powiedziała, że ​​ona i jej koledzy chcieliby wiele zrobić w programie — to znaczy położyć większy nacisk na podzmienne, które są przedmiotem obrotu.

Obecnie analiza wariantów została przeprowadzona tylko dla 21 stanowisk wartowniczych.

W ciągu ostatnich sześciu tygodni wskaźnik BA.4/5 w 21 witrynach wzrósł z mniej niż 3 procent do 73 procent.

„Przyglądamy się wielu różnym sposobom uzyskiwania lepszych informacji o wariantach, które mamy teraz – ale także odkrywania wariantów, o których prawdopodobnie jeszcze nie wiedzieliśmy” – powiedział Hewitt.

„Oprócz sekwencjonowania zaczynamy używać cyfrowego PCR do wykrywania określonych mutacji – które szybko wskazują proporcję wariantów w ściekach w czasie. Ta metoda pozwoli nam zeskanować więcej próbek niż istniejących 21 miejsc”.

Istniał również potencjał do wykorzystania monitoringu ścieków do modelowania probabilistycznego – uzupełniającego trendy, które urzędnicy byli w stanie zebrać na podstawie przypadków zgłaszanych przez społeczność i sekwencjonowania genomu.

Monitorowanie ścieków nie może jednak dokładnie wykryć liczby przypadków, które były obecne na danym obszarze w danym czasie.

„Chociaż wiemy, że poziom wirusa w ściekach wzrasta wraz ze wzrostem liczby przypadków, w danej grupie 1000 osób jedna osoba może mieć taką samą ilość wirusa jak 10 osób w innych miejscach” – powiedziała.

„Więc trudno to przełożyć na dokładną liczbę przypadków, ale jest to coś, czego naukowcy szukają na całym świecie”.

Hewitt powiedział, że poza Covid-19 istnieją plany rozszerzenia monitorowania ścieków na inne wirusy, takie jak wirus grypy i syncytialny wirus oddechowy (RSV).