Ryzyko zakażenia BA.5 wśród osób narażonych na wcześniejsze warianty SARS-CoV-2

Do edytora:

W ostatnich miesiącach omicron (B.1.1.529) stał się dominującą odmianą koronawirusa zespołu ostrej niewydolności oddechowej 2 (SARS-CoV-2), wykazując pewien stopień unikania odporności.¹ Podstawowe podwarianty omikronu, BA.1 i BA.2, są stopniowo wypierane przez BA.5 w wielu krajach, prawdopodobnie z powodu zwiększonej przepuszczalności i częściowego unikania odporności powodowanego przez BA.1 i BA.2.^2,3 Ochrona zapewniana przez BA.1 przed zakażeniem przez podzmienną BA.5 jest krytyczna, ponieważ dostosowane szczepionki w badaniach klinicznych opierają się na BA.1.

Portugalia była jednym z pierwszych krajów dotkniętych dominacją BA.5. Wykorzystaliśmy Krajowy Rejestr Choroby Koronawirusowej 2019 (Covid-19) (SINAVE) do obliczenia ryzyka zakażenia BA.5 wśród osób z udokumentowanym zakażeniem wcześniejszymi wariantami, w tym BA.1 i BA.2. Rejestr obejmuje wszystkie przypadki zgłoszone w kraju, niezależnie od obrazu klinicznego.

Rysunek 1. Rysunek 1. Ochronny wpływ wcześniejszego zakażenia SARS-CoV-2 na zakażenie wariantem Omicron BA.5.

Jak pokazano w panelu (a), zidentyfikowaliśmy okresy (w różnych kolorach), w których pojedynczy wariant był reprezentowany w ponad 90% izolatów próbki (dane z krajowego koronawirusa zespołu ostrej ostrej niewydolności oddechowej 2). [SARS-CoV-2] kontrola różnorodności genetycznej⁴). Okresy zaznaczone na szaro oznaczają czasy, kiedy w obiegu była więcej niż jedna zmienna. Biorąc pod uwagę stosunkowo powolne przejście między dominacją wariantu omicron BA.1 a dominacją wariantu omicron BA.2, w analizie połączyliśmy BA.1 i BA.2. Nie uwzględniliśmy żadnych osób zakażonych w ciągu 90 dni przed dominacją podczynnika omicron BA.5. Panel B pokazuje skuteczność ochrony przed infekcją w okresie kontrolnym BA.5 (od 1 czerwca 2022 r.) wśród osobników z pojedynczym zakażeniem w okresach dominacji różnych wariantów, jak pokazano w Panelu A, w porównaniu z osobnikami bez udokumentowanej infekcja od 1 czerwca. Do badania nie włączono osób z infekcją przed 1 czerwca. 𝙸 Słupki reprezentują 95% przedziały ufności.

Krajowy nadzór genetyczny pod kątem SARS-CoV-2 zidentyfikował okresy, w których różne warianty stanowią ponad 90% izolatów.⁴ Zidentyfikowaliśmy wszystkich badanych, którzy mieli pierwsze zakażenie w okresach kontrolnych dla każdej zmiennej, aby obliczyć ich ryzyko zakażenia w okresie kontrolnym BA.5 (Rysunek 1a). Połączyliśmy BA.1 i BA.2 ze względu na powolne przejście między dwiema podzmiennymi w populacji. Na koniec obliczyliśmy ryzyko BA.5 dla populacji, która nie miała udokumentowanej infekcji przed dominacją BA.5 (1 czerwca 2022).

Odkryliśmy, że poprzednia infekcja SARS-CoV-2 miała działanie ochronne przed infekcją BA.5 (Rysunek 1b oraz Tabela S1 w Dodatku Uzupełniającym, dostępnym wraz z pełnym tekstem tego listu na NEJM.org), a ochrona ta była maksymalna w przypadku wcześniejszej infekcji BA.1 lub BA.2. Dane te należy rozpatrywać w kontekście zakażenia penetracyjnego w populacji silnie zaszczepionej, biorąc pod uwagę, że ponad 98% populacji badanej w Portugalii ukończyło serię szczepień podstawowych przed 2022 r.

Projekt badania nie może wyeliminować wszystkich czynników zakłócających (patrz sekcja dyskusji w dodatku uzupełniającym). Ponadto jednym ograniczeniem jest domniemany efekt obniżonej odporności w populacji z heterozygotyczną odpornością (uprzednie zakażenie i szczepienie). Odkryliśmy, że zakażenie BA.1 lub BA.2 u zaszczepionych osobników zapewniało wyższą ochronę przed BA.5 niż zakażenie wariantami pre-omikronowymi, co jest zgodne z niedawnym doniesieniem o negatywnym projekcie testu.⁵ Jednak infekcje BA.1 lub BA.2 występowały bliżej okresu dominacji BA.5 niż infekcje wcześniejszymi wariantami. Istnieje przekonanie, że ochrona oferowana przez wcześniejsze zakażenie wirusem BA.1 lub BA.2 jest bardzo niska, biorąc pod uwagę dużą liczbę zakażeń BA.5 wśród osób wcześniej zarażonych wirusem BA.1 lub BA.2. Nasze dane sugerują, że ta percepcja jest prawdopodobnie wynikiem większej grupy osób z zakażeniem BA.1 lub BA.2 w porównaniu z zakażeniem innymi podzmiennymi i nie jest poparta danymi.

Ogólnie rzecz biorąc, odkryliśmy, że penetrujące infekcje wariantem BA.5 były mniej prawdopodobne wśród osób z wcześniejszą historią SARS-CoV-2 w silnie zaszczepionej populacji, szczególnie w przypadku wcześniejszych infekcji BA.1 lub BA.2, niż wśród osób niezakażonych … .

João Malato, MA.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Lizbona, Portugalia

Roy M. Ribeiro, Phil D.
Laboratorium Narodowe Los Alamos, Los Alamos, Nowy Meksyk

Pedro P. Leite, MD
Pedro Casaca, MD
dr Eugenia Fernandez
Direção Geral da Saude, Lizbona, Portugalia

dr Carlos Antunes
Uniwersytet w Lizbonie, Lizbona, Portugalia

Válter R. Fonseca, MD, Ph.D.
Direção Geral da Saude, Lizbona, Portugalia

dr Manuel C. Gomez
Uniwersytet w Lizbonie, Lizbona, Portugalia

Luis Graca, MD, Phil D.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Lizbona, Portugalia
[email protected]

Ta wiadomość została opublikowana 31 sierpnia 2022 r. na stronie NEJM.org.